Patterson函数中Harker峰新重叠规律研究 【摘要】:自上世纪三十年代末开展的蛋白质晶体结构的研究,均是以首先寻找晶体中的”重原子”为前提,如肌红蛋白与血红蛋白的晶体结构测定。至今,对于新的大分子结构的测定尤其是同源性差的结构,均是以先蛋白质晶体——重原子衍生物为起点。在上世纪七十年代有Passman教授等提出分子置换体,把Patterson函数的应用推向了一个新的起点——建立了以Patterson函数为基础的新的大分子结构计算方法。在晶体学计算方法中,由Patterson方法引出的以重原子为基础的许多计算方法——单对与多对同晶置换法,单波长与多波长反常散射法等也已成为当今结构分子生物学发展的坚实基础。但是,与晶体学结构解析的另一种方法——直接法的发展现状比较,Patterson法尚存在明显差距,至今在晶体结构分析软件中,依然缺乏如同直接法在小分子晶体结构计算中的自动化水平。本文就P-Harker峰中的”套间重叠性”问题进行了系统的研究,通过对230空间群各自所含有的Patterson-Harker峰计算分析后发现,在,计算的Patterson解中的Harker峰之间尚存在彼此之间的”相等关系”,我们称之为”P-H套间重叠性”。本研究小组集近十年的计算分析获得了这一问题结果,230空间群不同套Harker峰间的确存在新的相等关系重叠类型。计算表明,在24个Patterson峰中近5000个Harker峰,通过对各个Harker峰的峰内、不同Harker峰峰间的计算分析,得到了新的重叠规律结果,提出了对230空间群中各个Harker峰在峰内、不同套峰的峰之间的对称(相等)关系,这将为Patterson分析进入自动分析提供了正确的计算结果。对小分子、大分子含重原子晶体结构分析提出新的途径。
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