如何利用TCGA进行某个基因的临床相关性分析？ 在文献中看到这些，请问有没有好的资源可以学习的（比如b站视频）我找了好久都找不到
TCGA数据库中clinical数据的解析，文件格式xml 打开如图
临床数据 数据解析：名称解读tumor_tissue_site用于描述肿瘤的组织来源或发生部位histological_type用于描述肿瘤的组织学类型other_dx可能包含有关患者其他诊断或合并症的信息。这个字段通常用于记录除了主要研究癌症之外的其他临床诊断或病史。genderpatient_death_reasondays_to_birthdays_to_last_followup表示患者最后一次随访与某个参考日期之间的天数race种族bcr_patient_barcodebarcodetissue_source_site用于标识肿瘤样本的来源机构或医疗中心patient_idhistory_of_neoadjuvant_treatment用于记录患者是否接受过新辅助治疗informed_consent_verified用于指示患者是否已经提供并确认知情同意书icd_o_3_site用于指示肿瘤的原发部位icd_10是一种用于编码疾病、症状、异常体征、外部原因和社会因素的标准国际分类系统tissue_prospective_collection_indicator用于指示肿瘤组织样本的采集方式或收集指示器YES：表示组织样本是通过前瞻性收集方式的tissue_retrospective_collection_indicator表示患者从最初病理诊断到手术的天数age_at_initial_pathologic_diagnosis表示患者在最初病理诊断时的年龄year_of_initial_pathologic_diagnosis表示患者最初病理诊断的年份ethnicity表示患者的种族或民族背景person_neoplasm_cancer_status用于指示个体的肿瘤癌症状态day_of_form_completion表示患者表单（或记录）完成的日期month_of_form_completion表示患者表单（或记录）完成的月份year_of_form_completion表示患者表单（或记录）完成的年份anatomic_neoplasm_subdivision表示肿瘤的解剖学亚区划anatomic_neoplasm_subdivision_other通常用于提供肿瘤解剖学亚区划的其他信息或更详细的描述，当亚区划无法用常规分类表示时使用primary_lymph_node_presentation_assessment用于描述原发性淋巴结的呈现评估lymph_node_examined_count用于表示检查的淋巴结数量number_of_lymphnodes_positive_by_he用于表示通过组织病理学（HE染色）检测确定的淋巴结阳性数量number_of_lymphnodes_positive_by_ihc用于表示通过免疫组化染色（IHC）检测确定的淋巴结阳性数量stage_event是指确定肿瘤在身体中的扩散程度的过程，通常用于描述癌症患者肿瘤分期的事件system_versionclinical_stage这个字段通常表示患者在临床上被分配的癌症分期。癌症分期是根据患者的临床表现和检查结果确定的，通常包括肿瘤的大小、深度、淋巴结侵犯以及是否有远处转移等因素。pathologic_stage这个字段通常表示患者在病理学上被分配的癌症分期clinical_categories这个字段可能包含有关患者癌症类型或分期的分类信息pathologic_T肿瘤大小和范围pathologic_N淋巴结受累情况pathologic_M是否有远处转移psaPSA 测试通常用于检测前列腺癌的存在和跟踪患者的治疗响应gleason_grading评估前列腺癌组织活检样本的一种系统secondary_pattern通常与Gleason评分系统一起使用，用于描述前列腺癌的细胞形态特征tertiary_pattern通常也与 Gleason 评分系统一起使用，用于描述前列腺癌组织样本的形态特征ann_arbor是用于淋巴瘤（尤其是霍奇金淋巴瘤和非霍奇金淋巴瘤）的分期系统b_symptoms通常用于描述霍奇金淋巴瘤患者是否有 B 症状extranodal_involvement通常用于描述淋巴瘤是否涉及到淋巴结外的组织（Extranodal Involvement）serum_markers血清标志物igcccg_stageIGCCCG 分期masaoka_stageMasaoka 分期neoplasm_histologic_grade肿瘤组织学分级country_of_procurement样本的采集国家residual_tumor残余肿瘤reflux_history反流病史antireflux_treatment抗反流治疗antireflux_treatment_types抗反流治疗类型new_tumor_events新肿瘤事件new_tumor_event_after_initial_treatment初始治疗后的新肿瘤事件days_to_new_tumor_event_after_initial_treatment初始治疗后新肿瘤事件的天数new_neoplasm_event_types新肿瘤事件类型progression_determined_by_list进展是否由列表确定locoregional_procedure局部区域治疗follow_ups随访次数bcr_followup_barcodevital_status生存状态days_to_last_followup距最后随访的天数days_to_death距最后死亡的天数new_tumor_event_after_initial_treatment初始治疗后新肿瘤事件days_to_new_tumor_event_after_initial_treatmentadditional_surgery_locoregional_procedure额外的局部区域手术days_to_additional_surgery_locoregional_procedureadditional_radiation_therapy额外的放疗radiation_therapy放疗postoperative_rx_tx术后治疗additional_pharmaceutical_therapy额外的药物治疗additional_surgery_metastatic_procedure额外的转移手术followup_case_report_form_submission_reason随访病例报告表提交原因
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